Etymologien til Génolhac er svært omstridt: land med gyvel (på keltisk, "gen"), opprinnelsen til vannet, fra "aqua" ... vann (det er den mest anerkjente teorien) eller Genulius' land. I antikken lå Génolhac langs tinnveien, et metall som var helt nødvendig for bronseproduksjon. Dette tinnet kom fra Cassiteridene (Scillyøyene sørvest for Storbritannia) i britisk Cornwall. Det lå sannsynligvis på ruten til fønikerne, fokaierne og romerne. Denne stien skulle senere bli Régordane-veien (GR®700), som krysset Génolhac og forbandt den romerske provinsen med Auvergne (Nemausus-Gergovie).
Den samme usikkerheten hersker rundt etymologien til Régordane (Gordians vei? veien som forener Gard-elvene, gourds? eller kløftenes vei?). Det var sannsynligvis ruten Cæsar fulgte for å angripe arvernerne (jf. "Gallerkrigen" av Julius Cæsar). Karl Martell og hans etterfølgere brukte den også under forfølgelsen av sarasenerne. Det er kjent at Cévennes motsto den arabiske invasjonen bedre enn slettene. Det kan også ha vært en mulig rute for normannerne opp Cèze og Gardon. Føydalismen etablerte seg i Génolhac og Cévennes, som overalt ellers i Frankrike i middelalderen, for bedre å kunne motstå barbariske invasjoner etter Romerrikets fall.
På 1100- og 1200-tallet var Génolhac et delt herskap (co-seigneurie), og de første dominerende familiene var Anduze og Randon. Senere kom familiene Polignac, Budos, Conti og Roche. I denne regionen spilte familier som Polignac, Budos, Conti og Roche viktige roller, spesielt i lokalhistorien, som ofte var knyttet til motstand og kamper under religionskrigene. Polignac-familien er for eksempel ofte forbundet med fremtredende skikkelser i adelen, og deres innflytelse strakte seg over flere regioner. Budos-familien kan også ha hatt lokale røtter, og muligens spilt en rolle i forvaltningen av jorden og samfunnene. Familien Conti har på sin side forbindelser til perioder i den franske adelen som smelter sammen med den lokale kulturen. Roche-familien spilte sannsynligvis en rolle i hverdagslivet og lokale anliggender, selv om de er mindre kjente enn de andre.
Den geistlige herren var biskopen av Uzès. Biskopen hadde ikke bare kirkelige ansvarsområder, men også en viss verdslig makt. Som geistlig herre hadde han eiendommer og herredømme over regionen. Dette betydde at han var involvert i politiske og sosiale anliggender i sitt samfunn, ofte i konkurranse med verdslige herrer. Biskopen av Uzès kan ha spilt en rolle i avgjørende hendelser, som religionskrigene på 1500-tallet, da spenningen mellom katolikker og protestanter var på sitt høyeste. Noen biskoper forsøkte å opprettholde fred og enhet i regionen, mens andre, som de fleste geistlige på den tiden, var dypt forankret i sine overbevisninger. Han representerer virkelig en blanding av tro og makt.
Albigenserkorstoget (1209-1218) brakte med seg dype forandringer i disse gamle føydale områdene da de første herrene tok parti med grevene av Toulouse, etterfulgt av Ludvig den helliges (Saint Louis) anneksjon av Languedoc i 1226. Albigenserkorstoget hadde som mål å utrydde katarismen, en religiøs bevegelse som ble ansett som kjettersk av den katolske kirke. Katarene forkynte en spiritualitet som var svært forskjellig fra Romerkirkens, og deres innflytelse hadde spredt seg i Languedoc, inkludert regioner som Génolhac.
Siden de var åpent fiendtlige overfor den katolske doktrinen, tiltrakk katarene seg mange tilhengere, noe som skapte bekymring hos kirken og adelen. Korstoget ble igangsatt under påskudd av å gjenopprette kristen orden, men det utviklet seg raskt til en brutal og blodig krig. De militære kampanjene, ledet av Simon de Montfort og andre herrer, var preget av beleiringer, ødeleggelse av byer og massakrer av befolkningen, inkludert uskyldige. Génolhac, som ligger i Cévennes, var nær konfliktområdene. Innbyggerne ble sannsynligvis trukket inn i stormen og tvunget til å velge side mellom den katolske makten og katarenes tro. Dette klimaet av vold og mistenksomhet fikk konsekvenser for lokalsamfunnet i flere generasjoner.
Dominikanerne etablerte seg deretter i Génolhac. Dominikanerne, eller Prekebrødrene, er en religiøs orden grunnlagt på 1200-tallet av St. Dominikus. Deres oppgave var å forkynne evangeliet og bekjempe kjetteri, spesielt i en periode hvor religiøse spenninger var sterkt til stede. I Génolhac fant de sannsynligvis fruktbar jord for sitt oppdrag, spesielt på grunn av de varierte trosretningene som eksistererte i Cévennes. Dominikanerne var kjent for sitt fellesskapsliv og sin undervisning, noe som førte til at de slo seg ned i forskjellige regioner for å påvirke folks tro. Deres tilstedeværelse i Génolhac kan ha skapt en spesiell dynamikk mellom innbyggerne, kirken og lokale tradisjoner. De kan ha spilt en rolle i utdanning, men også i religiøse konflikter, særlig under reformasjonen og religionskrigene.
Randon-familien, som allerede var alliert med Anduze, etterfulgte dem. Randon, som mange familier fra gamle slekter, hadde en merkbar innflytelse på det lokale livet, særlig i en tid hvor forholdet mellom herrer og bønder var avgjørende. I Génolhac spilte de en rolle i landbruket, forvaltningen av jorden og til og med i religiøse anliggender, gitt den landlige og til tider tumultariske historiske konteksten. De deltok også i maktkampene under ulike urolige perioder, som religionskrigene eller økonomiske kriser. Randon-familien var også knyttet til lokal kultur ved å støtte håndverkere, skoler og veldedige tiltak. Hvert medlem av familien bidro, gjennom sine egne valg og handlinger, til å veve sammen det sosiale nettverket i samfunnet.
Det første frihetsbrevet. Den 12. mai 1228 mottok Génolhac sitt charter fra herr Bernard d'Anduze, nevø av grev Raymond VII av Toulouse; det ble bekreftet og supplert den 30. mars 1234. De første herrene ser ut til å ha hatt mye sympati for den oksitanske katarismen, mer av politiske årsaker enn av overbevisning. Det var i denne perioden at slottene Montclar og Verfeuil ble ødelagt. Dette charteret, som mange andre fra denne tiden, var et grunnleggelsesdokument eller en bekreftelse av rettigheter og privilegier gitt til et lokalsamfunn eller en kirke. Herrene forpliktet seg ofte til å beskytte bøndenes rettigheter, sikre rettferdighet på sine eiendommer og støtte innbyggernes åndelige liv.
I lys av korstoget mot albigenserne og de religiøse spenningene som rådet på den tiden, inkluderte Bernards charter klausuler om beskyttelse mot overgrep fra kirken eller rivaliserende adelsmenn, og understreket dermed hans rolle som forsvarer av innbyggerne. Slike chartre gjenspeilte maktforholdene og kampen for samfunnets overlevelse, og Bernard d'Anduzes charter spilte en viktig rolle i å etablere rettighetene til innbyggerne i Génolhac.
I 1271 krysset kong Ludvig IX regionen via Concoules, Génolhac og Portes på vei til Aigues-Mortes for korstoget der han skulle finne sin død under murene i Tunis. Kristendommen ble opprinnelig spredt i regionen av den hellige Martial (på 200-tallet), samt av andre tidlige munker og misjonærer. Kirken i Génolhac er beskyttet av den hellige Peter, i likhet med kirken i Portes, som senere ble lagt under den hellige Egidius (Saint Gilles). Føydalherrene spilte en stor rolle under korstogene, spesielt den gamle familien Hérail de Brésis. Familien Hérail de Brésis er en slekt som har vært sterkt knyttet til Cévennes-regionen, særlig i departementet Gard. Denne familien assosieres ofte med den lokale adelen og har spilt en viktig rolle i regionens sosioøkonomiske historie. Navnet Hérail nevnes ofte i historiske dokumenter, spesielt som grunneiere og lokale herrer. Medlemmer av denne familien involverte seg i lokale anliggender, inngikk strategiske allianser med andre adelsfamilier, og forvaltet land og ressurser.
I år 1300 ble dominikanerklosteret grunnlagt, noe som ble bekreftet i 1303 av pave Benedikt XI og deretter av Klemens V. Dominikanerklosteret i Génolhac er et viktig kapittel i regionens religiøse historie. Dominikanerne, kjent for sitt engasjement for undervisning og forkynnelse, grunnla klostre over hele Frankrike fra 1200-tallet, også i landlige områder som Génolhac. Dette klosteret fungerte trolig som et åndelig og sosialt sentrum for innbyggerne i regionen, og tilbød ikke bare et sted for tilbedelse, men også rammer for utdanning og opplæring. Prekebrødrene, som de kalles, var aktive i å spre den katolske troen og bekjempe kjetteri, særlig katarismen, som sto svært sterkt i Languedoc.
Den franske revolusjonen og moderne tid i Génolhac. Den 21. desember 1788 ble det holdt et forberedende møte for landsbyens konsuler. Den 11. mars 1789 ble klageboken (cahier de doléances) utarbeidet av herrene Bondurand Laroche og Lafont d'Aiguebelle. Lokale notabiliteter og presten Bouziges deltok. Den 14. juli 1789 ble herr de Roche, den lokale herren, utnevnt til kaptein for Génolhacs kompani på 60 menn. Han forærte kommunen dens første trikolorflagg. Nøyaktig ett år senere, 14. juli 1790, feiret man Føderasjonsfesten. I sognekirken velsignet presten Bouziges trikolorflagget som ble presentert av kaptein François de Roche. Den sivilrettslige grunnloven for geistligheten av 24. august 1790 møtte imidlertid sterk motstand blant presteskapet, som flyktet i store flokker til leiren i Jalès i Ardèche. Presten Bouziges søkte tilflukt i Tourévès hos den protestantiske Fabre-familien, og deretter i Finoune hos Veyras-familien. Slik unngikk han å bli forfulgt. Frihetstreet ble plantet på Colombier-plassen den 22. juli 1792.
Den 12. vendémiaire år IV (4. oktober 1795) førte forferdelige oversvømmelser til fire dødsfall i Génolhac og ved Pont de Rastel. Folketellingen i 1797 viste følgende tall: Génolhac hadde 1380 innbyggere, Concoules 899, Chamborigaud 695, Hiverne 492, Ponteils 306, Portes 1351, Bonnevaux 717, Malons 543 og Aujac 492. Den 16. mai 1824 ble byporten "Chef de Ville" revet, og i 1830 begynte man å rette opp husrekkene i Grand-rue. Fra 1834 til 1842 ble riksvei 106 mellom Nîmes og Moulins bygget (i dag fylkesvei CD 906).
I 1839 ble Pont de Rastel rammet av nye, ødeleggende oversvømmelser. Skolen i Pont de Rastel ble bygget i 1842, og det protestantiske tempelet i 1844. Den 10. mars 1861 ble byggingen av jernbanen fra Brioude til Alès kunngjort, men en stasjon i Génolhac var opprinnelig ikke planlagt. Beslutningen om å bygge stasjonen ble først tatt 10. april 1864. Viadukten i Chamborigaud sto ferdig i 1867. Tanninfabrikken (Ausset-Hermet) ble bygget i 1888. Dette årstallet kan fortsatt leses på fabrikkpipen. I april 1889 inntraff en tragisk gruvekatastrofe i La Vernarède. Det første prosjektet for en skole med fire klasser så dagens lys i 1894. I 1914 ble krigserklæringen forkynt midt under den lokale landsbyfesten. Génolhac mistet 39 av sine sønner i denne krigen. Mellom 1929 og 1931 ble det etablert en ungdomsskole (Cours Complémentaire).
Krigen fra 1939 til 1945 krevde livene til 5 innbyggere fra Génolhac. Motstandsbevegelsen hadde to geriljagrupper (maquis) i regionen: én i Sénéchas og én i Bouzèdes. Génolhac hedrer sine fire martyrer: Jean-François Pelet, drept i Vogesene, Aimé Crégut, drept ved Celas-brønnen (nær Alès), Georges Leyton, henrettet av tyskerne, og Robert Brun, skutt 5. juni 1944 foran hotellet Mont Lozère. Frigjøringen fant sted da 5. panserdivisjon (5e DB) rykket gjennom landsbyen den 30. og 31. august 1944. I 1950 ble det installert moderne vann- og kloakknett. Innvielsen av den nye ungdomsskolen fant sted i 1961. Tanninfabrikken ble lagt ned for godt i 1964. Mellom 1978 og 1980, under renoveringen av fasadene til to hus i Grand-rue, oppdaget man bygningsrester fra senmiddelalderen.